目前，有迹象表明，由于被Windows Server的应用软件、性能及价格所吸引，许多Linux的大型企业用户开始逐渐转向此操作系统。 
　　在Windows Server收益增长超过Linux系统――这一情况是自IDC调查公司从1998年追踪Linux系统的收益以来首次出现。最近将系统从Linux向Windows转换的公司有：消费者产品制造商Unilever、零售网站Overstock.com，法国运动游艇公司Areva Challenge以及加州糖果制造商Jelly Belly。
　　在由GfK Custom Research North America主办的网上调查――2007年微软高性能计算资本市场调查中，微软在该领域的潜力被突出。154个高性能处理产品资本市场的企业用户反馈显示，大约83%考虑在下一个工程中采用微软的解决方案，24%计划在下一年或一半年里将企业高性能处理环境增加1000个网点或者更多。
　　Sun微系统公司的用户也在从Solaris系统向微软Windows系统迁移。
　　不过，Solaris 操作系统的市场主管Dan Roberts却说：“一些人观望后又重新采用了Solaris系统。”一些用户重新采用x86解决方案，比如Mark Andreessen的社区网络公司Ning。他们考虑过采用红帽的操作系统，最后发现Solaris系统价格适宜；并且从可测量性和可靠性来看，超过了Linux系统。
　　对于这些变化，IDC公司的分析师Al Gillen指出：2006年，Linux系统的市场增长速度略超Windows，同时他说，他不认为当前的趋势是企业开始将系统由Linux转向其他操作系统。
　　“Linux系统的问题在于其许多功能尚未被广泛使用，比如客户操作系统环境的虚拟化，Linux系统在这一领域的配置是全新的，而Windows系统则可将当前服务器整合为虚拟服务器。”
　　Illuminata的分析师Gordon Haff说，大部分迁移系统的企业仅仅是对基础架构的一部分或某一特定配置进行转换。
　　“尽管人们通常把开源软件作为微软的替代品，但是我并没看到配置Linux系统的用户转换到别的系统或者重新选择Unix或Windows系统。因为，这样做并不省钱。”
　　尽管这样，一些企业的确还是进行了系统转换。
　　进行Linux系统到Windows系统转换的一个企业是零售网站Overstock.com，公司在1999年决定将其基于网络的业务建立在开放源码软件――主要是SUSE Linux系统上。但是公司很自然地选择为所有核心企业系统采用Linux系统，28台服务器中有20台是Linux系统，在2001年公司决定建立自己的仓库，从这时起，公司开始进行系统转换。这意味着更换内部配置，将基于Linux的命令管理系统更换为企业级仓库管理系统。
　　Overstock公司的国内系统主管Carter Lee说，“我们第一次感到Linux系统已经不是企业的唯一选择。企业增长速度很快，我们的需求在以同样的速度变化。现在每天处理并完成20000条指令，而以前每天只能处理1000条指令，这就是差别。”
　　考虑到这一选择，Overstock.com选择了运行于Windows系统上的HighJump软件解决方案。当前，Overstock.com已经拥有180台基于Windows server系统的计算机，这些计算机运行着公司大部分核心系统。
　　在2002年到2006年之间，Overstock.com公司配置了其他基于Windows Server系统的解决方案，包括客户管理系统和RightNow技术公司的服务软件；Nortel公司的电话语音系统解决方案；以及基于Microsoft Office SharePoint Portal Server 2003平台的企业内部员工局域网入口。